根據《財政部 商務部 稅務總局關于研發機構采購設備增值稅政策的公告》（2023年第41號，以下簡稱41號公告）規定，稅務總局制定了《國家稅務總局關于修訂<研發機構采購國產設備增值稅退稅管理辦法>的公告》（以下稱《公告》）?，F解讀如下：
一、制發背景是什么？
為鼓勵科學研究和技術發展，促進科技進步，國家決定延續實施研發機構采購國產設備退還增值稅政策（以下簡稱研發機構退稅政策），財政部、商務部及稅務總局制發41號公告。確保研發機構退稅政策落實到位，稅務總局配套制發了《公告》，擬就相關征管事宜予以明確，以便征納雙方遵照執行。
二、具體適用范圍是什么？
《公告》明確，適用41號公告的研發機構采購國產設備退稅業務，按照本《公告》申報辦理退稅。
三、研發機構如何辦理采購國產設備退稅備案？
符合41號公告政策適用條件的研發機構，應于首次申報采購國產設備增值稅退稅時，憑《出口退（免）稅備案表》、研發機構資質證明資料等，申請辦理退稅備案手續。需要提醒的是，《出口退（免）稅備案表》內容填寫要真實、完整，其中，“企業類型”應選擇“其他單位”，“出口退（免）稅管理類型”應依據資質證明材料填寫“內資研發機構（簡寫：內資機構）”或“外資研發中心（簡寫：外資中心）”。
四、研發機構如何辦理采購國產設備退稅備案的變更和撤回？
（一）如何辦理備案變更。已辦理備案的研發機構，《出口退（免）稅備案表》中內容發生變更的，須自變更之日起30日內，持相關資料向主管稅務機關辦理備案變更。
（二）如何辦理備案撤回。研發機構發生解散、破產、撤銷以及其他依法應終止采購國產設備退稅事項的，應持相關資料向主管稅務機關辦理備案撤回。主管稅務機關應按規定結清退稅款后，辦理備案撤回。外資研發中心在退稅資格復審前，因自身條件發生變化，已不符合研發機構的條件，應自條件變化之日起30日內辦理退稅備案撤回。
五、研發機構如何進行采購國產設備退稅申報？
研發機構申報采購國產設備退稅時，需提交《購進自用貨物退稅申報表》、采購國產設備合同、增值稅專用發票等資料?？赊k理的退稅額，為增值稅專用發票上注明的稅額。
? ? 六、研發機構辦理退稅的申報期限規定如何？
研發機構采購國產設備申報期限為采購國產設備之日（以發票開具日期為準）次月1日起至次年4月30日前的各增值稅納稅申報期。
同時，為持續優化營商環境，更好服務市場主體，避免納稅人因未及時收齊退稅憑證而無法申報辦理退稅，根據《財政部 稅務總局關于明確國有農用地出租等增值稅政策的公告》（2020年第2號）第四條“納稅人出口貨物勞務、發生跨境應稅行為，未在規定期限內申報出口退（免）稅或者開具《代理出口貨物證明》的，在收齊退（免）稅憑證及相關電子信息后，即可申報辦理出口退（免）稅”的規定,《研發機構采購國產設備增值稅退稅管理辦法》明確，若研發機構未能在規定的期限內申報退稅，待收齊憑證及信息后，仍可繼續申報辦理退稅。
七、稅務機關如何審核辦理退稅？
屬于增值稅一般納稅人的研發機構申報采購國產設備退稅，主管稅務機關經審核符合規定的，應按規定辦理退稅。
研發機構申報采購國產設備退稅，如果發現“審核中發現疑點，經核實仍不能排除疑點”“非增值稅一般納稅人申報退稅”等情形，主管稅務機關應采取發函調查或其他方式調查，在確認增值稅專用發票真實，且發票所列設備已由上游按規定申報納稅后，方可辦理退稅。
? ? 八、已退稅的國產設備轉移或移作他用如何處理？
已辦理增值稅退稅的國產設備，自增值稅專用發票開具之日起3年內，設備所有權轉移或移作他用的，研發機構須按照規定向主管稅務機關補繳已退稅款。補繳已退稅款按以下方法計算：
應補繳稅款＝增值稅專用發票上注明的稅額×（設備折余價值÷設備原值）
設備折余價值＝增值稅專用發票上注明的金額-累計已提折舊 ? ??
累計已提折舊按照企業所得稅法的有關規定計算。
九、如果研發機構發生違法違規，如何處理？
研發機構騙取采購國產設備增值稅退稅的，主管稅務機關應追回已退稅款，并依照稅收征管法的有關規定處理。研發機構涉及重大稅收違法失信案件被依法公布信息的，研發機構將停止享受采購國產設備退稅政策，并應及時辦理退稅備案撤回。
十、執行期限規定是什么？
修訂后的《研發機構采購國產設備增值稅退稅管理辦法》自2024年1月1日起施行，具體以增值稅發票的開具日期為準。
